ストーリー

マリオとルイージの活躍で平和になったキノコ王国ではありましたが、このキノコ王国はキノコワールド のほんの入口。その奥には多数の不思議な国がありました。さんざんこらしめたはずの大魔王クッパも マリオのいるキノコ王国からは手を引いたものの今度は自分の子供コクッパ７兄弟を仲間に入れ、 ワールドのあちこちでイタズラのやり放題。遂には各国に古くから伝わる魔法の杖を盗み出し王様達を 動物の姿に変えてしまいました。マリオとルイージはコクッパから杖を奪い返し、王様を元の姿に 戻してあげなくてはなりません。 「行ってらっしゃい。気をつけてネ」ピーチ姫とキノピオに見送られて２人は不思議いっぱいのキノコ ワールドの奥へ奥へと進んでゆくのでした。

お待たせしました。スーパーマリオブラザーズ第３弾、ついに登場です。キノコ王国 からキノコワールドへと舞台を移し、クッパ軍団と三度対決。今回は大魔王クッパの 子供達、子クッパ７兄弟が敵に加わりキノコワールドのあちこちでイタズラのやり放題。 遂には７つの国の王様を魔法の杖で動物の姿に変えてしまいます。マリオとルイージは キノコワールドに平和を取り戻すため、ピーチ姫に見送られ冒険へと旅立つのでした。

マリオとルイージの活躍で、クッパ軍団を撃退したキノコ王国。そこはキノコワールドのほんの入口で、 その奥にはたくさんの不思議な国々がありました。
キノコ王国から手を引いた大魔王クッパでしたが、今度は何と自分の子ども”コクッパ７人衆”まで動員 し、ワールドのあちこちで悪事のやり放題。遂には各国に古くから伝わる魔法の杖を盗み出し、王様たち を動物の姿に変えてしまったのです。王様を元の姿に戻すには、コクッパたちから魔法の杖を奪い返さなく てはなりません。
「いってらっしゃい。気をつけて！！」
ピーチ姫とキノピオに見送られ、マリオ&ルイージの兄弟は、謎がいっぱいのキノコワールドの、奥へ奥へと 進んでいくのでした。